Etelä-Suomessa on havaittu runsaasti sinilevää kahdella valtakunnallisen sinileväseurannan sisävesihavaintopaikoista.
Suomen ympäristökeskuksen mukaan levähavainnot ovat pääosin Etelä-Suomesta, missä havaintoja on tehty yhdeksältä sisävesien havaintopaikalta.
Myös Suomenlahdella ja Saaristomeren rannikolla on havaittu sinilevää.

