Kotioloissa kaikki kärpäslajit voidaan ennaltaehkäistä ja torjua miltei samanlaisin keinoin.
Suomessa ihmisille ja eläimille aiheuttavat haittaa lähinnä kaksi kärpäslajia: huonekärpänen ja pistokärpänen. Muita sisätiloissa esiintyviä lajeja ovat lamppukärpänen, liha-, kiilto- ja ullakkokärpänen, ruutukärpänen sekä mahlakärpäsiin kuuluva etikkakärpänen.
Yleisesti ottaen kärpäsiä houkuttelevat puoleensa kaikenlaiset eloperäiset aineet ja jätökset. Asunnoissa ne elävät lämpiminä vuodenaikoina, mutta karjasuojissa niitä kuoriutuu ympäri vuoden. Kärpästen liikkuminen ruoanjätteiden, ulosteiden ja pilaantuneen lihan välillä on epämiellyttävää, mutta se aiheuttaa myös terveysriskin.
Kärpästen aiheuttamat haitat
Huonekärpänen (Musca domestica) munii jätöksiin, kompostikasojen päälle ja jätteiden pinnalle. Aikuiset kärpäset lentävät sisään asuntoihin ja tuovat jaloissaan ja imukärsässään bakteereja elintarvikkeisiin levittäen varsinkin vatsasairauksia. Ne myös likaavat kodin pinnat ulosteillaan. Karjasuojissa ne hidastavat nuorten eläinten kehitystä ja alentavat maidontuotantoa.
Pistokärpänen (Stomoxys calcitrans) häiritsee eläimiä kuten huonekärpänen. Se imee kärsällään verta eläimestä ja voi pistää ihmistäkin. Pisto on kivulias ja se voi levittää bakteereita.
Lamppukärpänen (Fannia canicularis) on kodeissa harmiton, mutta kanaloissa ja turkistarhoissa siitä on haittaa eläimille.
Lihakärpänen (Calliphora) munii lihaan ja kalaan sekä niistä valmistettuihin tuotteisiin. Lihakärpänen saattaa levittää suolistosairauksia, joita voivat aiheuttaa myös raato-, kiilto- ja ruutukärpänen.

