Värit ja niiden yhdistelmät ovat yksi puutarhan keskeisimmistä elementeistä. Eivät ainoastaan kasvien värit, sillä puutarhan värimaailmaa suunnitellessa on otettava huomioon paitsi kasvien, myös sinne sijoitettavien esineiden ja ympäröivien rakennusten väritys.
Kasvikunnanhallitseva väri on vihreä, joka esiintyy puutarhassakin monin eri sävyin. Eniten kasvit vaikuttavat kuitenkin katsojaan kukintojensa kautta. Kukilla puutarhaan saadaan yhtä hyvin ihastuttavia väriläikkiä kuin hillittyjä värikokonaisuuksiakin. Jokainen kukkaryhmä antaa puutarhaan ja sen tunnelmaan oman, ainutlaatuisen leimansa. Varjoisaan paikkaan istutettavan kasvillisuuden pääpaino on kylläkin lehtimuodoissa ja vihreän eri sävyissä, mutta aurinkoisemmassa paikassa voidaan toteuttaa hyvinkin iloisesti räiskyviä värikimaroita.
Mikäli värien käyttö ja niiden yhdisteleminen toisiinsa tuntuu hankalalta, voi turvautua värioppiin ja sen lainalaisuuksiin. Tutkimalla vanhastaan tuttua työkalua, väriympyrää jokainen pääsee nopeasti perille siitä, millaisia tunnelmia eri värit keskenään luovat. Valkoinen ryhmä tai ryhmä, jossa värit sointuvat sävy sävyyn viestii hillittyä eleganssia, vastaväreistä toteutettu on puolestaan pirteän eloisa.
